Molekularni sitovi tipa Y imajo tesno pakirano šesterokotno strukturo, podobno diamantu. If the beta cage is used as the structural unit to replace the carbon atom nodes of the diamond, and the two adjacent beta cages are connected with hexagonal columnar cages, that is, the five beta cages are connected together with four hexagonal columnar cages, of which one beta cage is located in the center and the remaining four beta cages are located at the vertex of the tetrahedron, an octahedral Nastala je zeolitna kristalna struktura. Z nadaljevanjem povezave s to strukturo dobimo molekularno strukturo sita tipa Y. V tej strukturi je velika kletka, ki jo tvorita β kletka in šesterokotna stolpčna kletka, osemstranska zeolitna kletka, njihove medsebojno povezane okenske luknje pa je dvanajst binarnih obročev, katerih povprečna učinkovita velikost por je 0,74 nm, kar je velikost pore molekularne sive tipa Y. Molekularna sita tipa X in molekularna sita tipa je popolnoma enaka, vendar je molekularno sito sivo sive silicije aluminija, hidrotermalna stabilnost je močna, zato se širše uporablja.
